2006, Número 1
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Rev Educ Bioquimica 2006; 25 (1)
Determinación de la topología de transportadores bacterianos
Jiménez R, Cervantes C
Idioma: Español
Referencias bibliográficas: 16
Paginas: 3-11
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RESUMEN
Los transportadores de membrana son proteínas que desempeñan
papeles esenciales para el adecuado funcionamiento
de todos los organismos vivos. En las bacterias, la captación
de nutrientes y la expulsión de sustancias nocivas se
encuentran entre sus funciones principales. La estructura
de los transportadores está dada en gran parte por sus
interacciones con la membrana celular, por lo que el análisis
topológico, esto es, la determinación del número y la
orientación de los segmentos transmembranales (STM) con
respecto a la bicapa lipídica, es fundamental para comprender
su función. La información sobre la topología membranal
puede usarse para la identificación de residuos esenciales
o para conocer el origen evolutivo de los transportadores.
Se ha diseñado una variedad de métodos bioquímicos
para el estudio de la topología de las proteínas de membrana.
Estos métodos se basan en modificaciones genéticas
que permiten distinguir la localización en la membrana de
regiones específicas de las proteínas en estudio. En este
trabajo se resumen los hallazgos reportados sobre la topología
de transportadores bacterianos, con énfasis en los sistemas
que transportan iones inorgánicos. De un total de 111
transportadores analizados, destacan dos grupos: uno que
atraviesa una sola vez la membrana y otro grupo que posee
12 STM; además, hay varias proteínas con 4, 6, 8 ó 10 STM.
REFERENCIAS (EN ESTE ARTÍCULO)
von Heijne G (1992) Membrane protein structure prediction. Hydrophobicity analysis and the positiveinside rule. J Mol Biol 225:487-94.
Moller S, Croning MD, Apweiler R (2001) Evaluation of methods for the prediction of membrane spanning regions. Bioinformatics 17:646-53.
van Geest M, Lolkema JS (2000) Membrane topology and insertion of membrane proteins: search for topogenic signals. Microbiol Mol Biol Rev 64:13-33.
Derman AI, Beckwith J (1991) Escherichia coli alkaline phosphatase fails to acquire disulfide bonds when retained in the cytoplasm. J Bacteriol 173:7719-22.
Snyder WB, Silhavy TJ (1995) Beta-galactosidase is inactivated by intermolecular disulfide bonds and is toxic when secreted to the periplasm of Escherichia coli. J Bacteriol 177:953-63.
Feilmeier BJ, Iseminger G, Schroeder D, Webber H, Phillips GJ (2000) Green fluorescent protein functions as a reporter for protein localization in Escherichia coli. J Bacteriol 182:4068-76.
Adler J, Bibi E (2002) Membrane topology of the multidrug transporter MdfA: complementary gene fusion studies reveal a nonessential C-terminal domain. J Bacteriol 184:3313-20.
Gouffi K, Gerard F, Santini CL, Wu LF (2004) Dual topology of the Escherichia coli TatA protein. J Biol Chem 279:11608-15.
Newton SM, Klebba PE, Michel V, Hofnung M, Charbit A (1996) Topology of the membrane protein LamB by epitope tagging and a comparison with the X-ray model. J Bacteriol 178:3447-56.
Mondigler M, Ehrmann M (1996) Site-specific proteolysis of the Escherichia coli SecA protein in vivo. J Bacteriol 178:2986-88.
Aguilera S, Aguilar ME, Chávez MP, López-Meza JE, Pedraza-Reyes M, Campos-García J, Cervantes C (2004) Essential residues in the chromate transporter ChrA of Pseudomonas aeruginosa. FEMS Microbiol Lett 232:107-12.
Saier MH Jr (2003) Tracing pathways of transport protein evolution. Mol Microbiol 48:1145-56.
Rensing C, Ghosh M, Rosen BP (1999) Families of softmetal- ion-transporting ATPases. J Bacteriol 181:5891-97.
Saaf A, Baars L, von Heijne G (2001) The internal repeats in the Na+/Ca2+ exchanger-related Escherichia coli protein YrbG have opposite membrane topologies. J Biol Chem 276:18905-07.
Wallin E, von Heijne G (1998) Genome-wide analysis of integral membrane proteins from eubacterial, archaean, and eukaryotic organisms. Protein Sci 7:1029-38.
Manoil C, Beckwith J (1986) A genetic approach to analyzing membrane protein topology. Science 233:1403-08.