2013, Número 2
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Revista Cubana de Informática Médica 2013; 5 (2)
Funciones de transferencia en el perceptrón multicapa: efecto de su combinación en entrenamiento local y distribuido
Mejías CY, Carrasco VR, Ochoa II, Moreno LE
Idioma: Español
Referencias bibliográficas: 14
Paginas: 1-19
Archivo PDF: 266.68 Kb.
RESUMEN
El perceptrón multicapa (PMC) figura dentro de los tipos de redes neuronales artificiales (RNA) con resultados útiles en los estudios de relación estructura-actividad. Dado que los volúmenes de datos en proyectos de Bioinformática son eventualmente grandes, se propuso evaluar algoritmos para acortar el tiempo de entrenamiento de la red sin afectar su eficiencia. Se desarrolló un algoritmo para el entrenamiento local y distribuido del PMC con la posibilidad de variar las funciones de transferencias para lo cual se utilizaron el Weka y la Plataforma de Tareas Distribuidas Tarenal para distribuir el entrenamiento del perceptrón multicapa. Se demostró que en dependencia de la muestra de entrenamiento, la variación de las funciones de transferencia pueden reportar resultados mucho más eficientes que los obtenidos con la clásica función Sigmoidal, con incremento de la g-media entre el 4.5 y el 17 %. Se encontró además que en los entrenamientos distribuidos es posible alcanzar eventualmente mejores resultados que los logrados en ambiente local.
REFERENCIAS (EN ESTE ARTÍCULO)
Sremac S, Skrbk B, Onjia A. Artificial neural network prediction of quantitative structure - retention relationships of polycyclic aromatic hydocarbons in gas chromatography. J Serb Chem Soc. 2005;70(11):1291-300.
Bolanca T, Cerjan-Stefanovic S, Ukic S, Rogosic M, Lusa M. Application of different training methodologies for the development of a back propagation artificial neural network retention model in ion chromatography. J Chemometrics. 2008;22:106-13.
Lendasse A, Ji Y, Reyhani N, Verleysen M. LS-SVM Hyperparameter Selection with a Nonparametric Noise Estimator. In: Artificial Neural Networks: Formal Models and Their Applications–ICANN 2005. Springer Berlin Heidelberg; 2005:625-30.
Sutherland JJ, O’Brien LA, Weaver DF. A Comparison of Methods for Modeling Quantitative Structure-Activity Relationships. J Med Chem. 2004;47(22):5541-54.
Lucic B, Nadramija D, Basic I, Trinajstic N. Toward Generating Simpler QSAR Models: Nonlinear Multivariate Regression versus Several Neural Network Ensembles and Some Related Methods. J Chem Inf Comput Sci. 2003;43:1094-102.
Huang L, Lu H-M, Dai Y. Feature Selection of Support Vector Regression for Quantitative Structure-Activity Relationships (QSAR). The International Conference on Mathematics and Engineering Techniques in Medicine and Biological Sciences (METMBS’03) (Paper ID # : 269ME); 2003.
Escalona-Arranz JC, Carrasco-Velar R, Padrón-García JA. Introducción al diseño racional de fármacos. La Habana: Editorial Universitaria, Ministerio de Educación Superior; 2008.
Hall M, Frank E, Holmes G, Pfahringer B, Reutemann P, Witten IH. The WEKA Data Mining Software: An Update. ACM SIGKDD Explorations Newsletter. 2009;11(1):10-18.
Colectivo de Autores. Tarenal, Plataforma de Tareas Distribuidas, Proyecto Grid. Manual del desarrollador. Universidad de las Ciencias Informáticas, La Habana, Cuba; 2009.
SPSS Inc. SPSS 13 for Windows. 13.0 ed: Copyrigth (c) SPSS Inc. 1989-2004. All rigths reserved; 2004.
Universidad Complutense de Madrid. Departamento de Sociología. Introducción al análisis de datos [citado el 15 Marzo 2013] Disponible en: http://www.ucm.es/info/socivmyt/paginas/D_departamento/materiales/ analisis_datosyMultivariable/19nparam_SPSS.pdf
Heaton J. Introduction to Neural Networks for Java. 2nd ed. St. Louis, Missouri: Heaton Research, Inc.; 2008.
Carrasco-Velar R. Nuevos descriptores atómicos y moleculares para estudios de estructura-actividad: Aplicaciones [PhD. Thesis]. La Habana: Universidad de La Habana; 2008.
Hernández-Díaz Y. Desarrollo de modelos de clasificación de actividad biológica empleando Máquinas de Soporte Vectorial [Master]. La Habana: Universidad de las Ciencias Informáticas; 2010.