2022, Número 2
Medisur 2022; 20 (2)
Conteo de bacterias y levaduras en imágenes digitales
Peña MJ, Alvarado CY, Orozco MR, Pichardo T, Abreu LA
Idioma: Español
Referencias bibliográficas: 15
Paginas: 243-256
Archivo PDF: 671.29 Kb.
RESUMEN
Fundamento: en los laboratorios de microbiología, la identificación y conteo de microorganismos es un procedimiento habitual. Aunque existen en el mercado equipos que posibilitan su realización de manera automática o semiautomática, son muy costosos, por lo cual esta tarea, difícil e irritante para los ojos, la siguen realizando los expertos de manera tradicional mediante la observación de las muestras en los microscopios, con la consiguiente variabilidad entre ellos.Objetivo: proponer un nuevo método para el conteo de bacterias y levaduras en imágenes digitales, bajo diferentes magnificaciones, tomadas a bioproductos de origen microbiano obtenidos por fermentación.
Métodos: el sensor empleado para la toma de imágenes de las muestras fue una cámara digital modelo HDCE-X, con un sensor CMOS de ½", con una resolución de 2592 píxeles por 1944 píxeles (5 Mp). Se emplearon dos tipos de magnificaciones: magnificación 40x (PL40, 0.65 apertura numérica and 0.17 de distancia de trabajo) y magnificación 100x (HI plan 100/1.25 con inmersión de aceite). El método propuesto se basa en técnicas de procesamiento digital de imágenes, utilizando herramientas como la detección de contornos, operaciones morfológicas y análisis estadístico, y fue desarrollado en lenguaje Python con empleo de la biblioteca OpenCV.
Resultados: la detección y conteo de bacterias se logró con una exactitud y precisión aceptable, en ambos casos por encima de 0,95; no en el caso de las levaduras cuya exactitud y precisión fueron menores, alrededor de 0,78 y 0,86 respectivamente. Se proponen flujos de trabajo basados en técnicas de procesamiento digital de imágenes, fundamentalmente en detección de contornos, operaciones morfológicas y análisis estadístico.
Conclusiones: el método posee una efectividad aceptable para el contexto y depende de las características que presenten las imágenes.
REFERENCIAS (EN ESTE ARTÍCULO)
Martirena F, Rodríguez Rodríguez Y, Callico A, Díaz Y, Bracho G, Hereira A, et al. Microorganism-based bioplasticizer for cementitious materials. In: Pacheco Torgal F, Ivanov V, Karak N, Jonkers H, eds. Biopolymers and Biotech Admixtures for Eco-Efficient Construction Materials. Sanwston: Woodhead Publishing; 2016. Disponible en: https://www.researchgate.net/publication/285387020_Microorganism-based_bioplasticizer_for_cementitious_materials15.